物流管理的組織結構需要企業(yè)根據(jù)自身的規(guī)模、戰(zhàn)略、技術和生產(chǎn)方式選擇實際的組織結構。在企業(yè)物流發(fā)展過程中，逐漸形成了以下四種典型的物流管理組織模式：（1）協(xié)同管理組織。目前，我國少數(shù)物流過程已經(jīng)實現(xiàn)了單一領導機構對整個物流過程的領導，但大部分還處于分工狀態(tài)。在國外，由于物流過程太長、范圍太大，很多物流過程不可能實現(xiàn)單一組織的領導。必須是多部門、多企業(yè)、多環(huán)節(jié)的合作。因此，有必要建立一個有效的合作管理組織。合作經(jīng)營組織主要有兩種形式：建立聯(lián)合領導組織；以委托、分包形式建立以委托人為中心的合作領導體制。

（2）直接管理組織。直接管理物流是許多以利潤為中心的物流企業(yè)和物流利潤源的共同管理體系。在這種管理體制中，物流是企業(yè)中對總經(jīng)理直接負責的行政部門。具有獨立開展活動的能力。實際上，它是公司的業(yè)務部門。（3）分散管理組織。在大型或巨型企業(yè)中，由于企業(yè)規(guī)模龐大，每個領域都有自己的物流功能，有物流組織來滿足子領域?qū)ξ锪鞯男枨?。各子領域的物流活動對該領域的主體運作起著支撐和保障作用，與各領域的主體活動密切相關。因此，這些領域的物流活動不可能在這個領域內(nèi)分離，物流管理必須分散在各個領域，企業(yè)只能實行分散管理。

（4）后勤輔助組織。物流子公司是大型或巨型企業(yè)，在總公司等業(yè)務單位下設子公司，并與該子公司共同成為巨型企業(yè)或企業(yè)集團的企業(yè)聯(lián)合體成員。子公司比公司內(nèi)的業(yè)務單元更為獨立，是典型的“利潤中心”物流企業(yè)。子公司、總公司與其他公司之間的關系，可以采取一般聯(lián)合、相互持股、甚至總公司控股的形式。